鉴定所占地面积共计6000平米，根据不同的业务功能将全楼分为对外接检区、办公区、实验区、教学区和公共职能区几大区域。其中实验室（含样品室）面积1500平米，接待室面积为400平米。此外，河南大学司法鉴定中心所设有独立的档案室、图书资料阅览室，并由专人进行管理，确保其安全性。各工作区域设置合理，功能划分科学，减少相互干扰。本所还特别建立了《设施与环境管理程序》、《现场鉴定/检验工作程序》用于设施与环境的维护和管理，设有现场防护制服和专业提取工具。对于特定区域，设置有录音、录像设置，确保保存相关证据资料。